ציוד לניקוי גרגרים מפריד בין גרגרים וזיהומים על סמך הבדלים בתכונות הפיזיקליות כגון גודל חלקיקים, משקל סגולי, צורה, מאפייני זרימת אוויר ועמידות בפני חיכוך והשפעה. הסוגים העיקריים כוללים ציוד המפריד לפי גודל חלקיקים, משקל סגולי, צורה, מאפייני זרימת אוויר ועמידות בפני חיכוך ופגיעה, כמו גם ציוד משולב המשלב פונקציות סינון מרובות.
ציוד המפריד לפי גודל החלקיקים משתמש ברשת תיל ארוגה או לוחות מתכת מחוררים כמשטח המסך, תוך ניצול גודל פתחי המסך להקרנה. ציוד עם פתחי מסך גדולים מעט מהקוטר המקסימלי של חלקיקי הגרגר מאפשר מעבר תבואה וזיהומים קטנים יותר דרך פתחי המסך, בעוד זיהומים גדולים יותר נפלטים כגודל יתר. דוגמאות כוללות מסכי טומאה גדולים ומסכים גליליים, המשמשים בדרך כלל לניקוי מקדים כאשר תבואה נכנסת למחסן. ציוד עם פתחי מסך הקטנים מהקוטר המינימלי של חלקיקי התבואה מאפשר מעבר והסרה של זיהומים קטנים, בזמן שהגרגר נפלט כגודל יתר. זה כולל מסכי רטט הדדיים, מסכים סיבוביים שטוחים ומסכי רטט במהירות-גבוהה, המשמשים לניקוי לאחר יציאת התבואה מהמחסן ולפני עיבוד. למסכי רטט הדדיים יש בדרך כלל שלוש שכבות של משטחי מסך כדי לפרוק בנפרד זיהומים גדולים, סוגים שונים של גרגרים וזיהומים קטנים. למסך סיבובי מישור יש גוף מסך תלוי בום המסתובב בתנועה מישורית, ויש לו שני משטחי מסך. למסך רטט במהירות-גבוהה יש גוף מסך שנע בתנועה מעגלית-קטנה במישור אנכי, ויש לו שניים עד ארבעה משטחי מסך. זה יעיל להפרדת עשב אסם מאורז.
הפרדת כוח הכבידה משמשת להפרדת זיהומים הדומים בגודל ובצורה לחלקיקי דגן אך שונים במשקלם, כגון אבנים ובוץ. השיטות כוללות תהליכים רטובים ויבשים. ציוד אופייני להפרדה רטובה הוא מכונת כביסה וייבוש חיטה, בעוד שציוד הפרדה יבשה כולל מסיר אבן כבידה וטבלת דירוג כבידה. מסיר הכבידה משתמש בלוח מחורר רוטט נוטה והולך וזרימת אוויר מבוקרת כדי לגרום לתבואה לזרום במצב חצי- תלוי כלפי מטה ולהיפרש. זיהומים כבדים יותר נצמדים למשטח הצלחת, עולים ונפלטים דרך אזור איסוף האבנים.- טבלת דירוג הכבידה פועלת בדומה לפורקן הכבידה, תחילה מפריד את התבואה לשני חלקים לפי משקלם ולאחר מכן מנקה אותם בנפרד. ציוד הפרדה יבש חוסך מים ומונע זיהום שפכים.